Самый очевидный и правильный вариант для предложенной задачи:
mysqldump --host A | convert_dump | mysql --host B
К слову, использование FILE никак не вылечит от нагрузки/трафика. И от шага convert_dump не избавит, поскольку в задаче поставлена разная структура БД.А вообще подобный идиотизм лечится грамотной statement-based репликацией в нужном направлении. Заметьте - репликацией возможно даже не на уровне MySQL. При этом нагрузка реально минимизируется. Если не хватает головы/рук чтобы такое сделать, и не мучать сервер дампами - ССЗБ.
У нас так (самописной репликацией) архивируется реалтаймовая база аккаунтинга, потому что если делать хоть дамп, хоть FILE - таскать 80-100 гиг каждые пару часов весьма невесело. Это я все к тому, что задача поставлена идиотская, и решать её "в лоб" (дампом) может только студент-"практик", который дальше шаблонов не идёт.